不要一起加，在用硝化细菌前，假如水非常混浊，可先加净水剂解决，待沉淀后用虹吸法吸去沉淀物，并且用时先放置过液的水换去缸水的1/3，接着加入硝化细菌。
硝化细菌和净水剂起着的功效是完全不一样的。净水剂是靠絮凝功效在很短的时间内，将悬浮颗粒吸附过来形成比较大的颗粒而沉淀，随后由水泵将其抽到过滤器中，实现澄清水质的功效。如此的水尽管是清的，可是里头的氨氮却依旧存在，对鱼的危害功效依旧存在，鱼该得病还得病。而硝化细菌的功效则是将水里有毒的氨氮清除掉的，如此的水即使不那样清，可是鱼却不会因为氨中毒而得病或死亡。